一、實(shí)驗(yàn)室簡(jiǎn)介
PI簡(jiǎn)介
楊一帆，本科就讀于北京大學(xué)元培學(xué)院，先后學(xué)習(xí)數(shù)學(xué)和生命科學(xué)，2008年獲得生命科學(xué)學(xué)士學(xué)位。于2011年和2016年獲得法國(guó)巴黎第五大學(xué)碩士和博士學(xué)位。2019年于以色列威茲曼研究所開(kāi)展博士后研究，師從于系統(tǒng)生物學(xué)大師Uri Alon。已于2025年1月加入西湖大學(xué)，擔(dān)任特聘研究員，研究興趣集中在生物衰老中的非線性動(dòng)力學(xué)，統(tǒng)計(jì)物理和定量生理學(xué)。
實(shí)驗(yàn)室方向
本課題組將結(jié)合濕實(shí)驗(yàn)，理論建模和計(jì)算方法，從系統(tǒng)學(xué)的角度研究生物衰老。研究方向分為：細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)和細(xì)胞周期調(diào)控的系統(tǒng)規(guī)律，以及哺乳動(dòng)物衰老與組織穩(wěn)態(tài)。
（一）生物衰老的第一性原理
在現(xiàn)有的生物衰老研究中，傳統(tǒng)的分子遺傳學(xué)和分子細(xì)胞學(xué)等自下而上的方法面臨復(fù)雜性、隨機(jī)性和涌現(xiàn)性等挑戰(zhàn)。雖然許多與衰老相關(guān)的生物過(guò)程已被確定為衰老標(biāo)志，但它們之間的相互作用如何具體導(dǎo)致個(gè)體衰老并決定壽命仍然不清楚。
所有復(fù)雜系統(tǒng)，無(wú)論是生命體還是非生命體，包括工程系統(tǒng)如汽車、飛機(jī)，甚至材料，都會(huì)隨著時(shí)間的推移變得功能下降，更易受到損傷和最終失效的影響。這背后的根本原理在于，構(gòu)成這些系統(tǒng)的“零件”有相互依賴的關(guān)系。因此，對(duì)這些系統(tǒng)如何失效的定量研究，可以反映出這些系統(tǒng)內(nèi)部的相互依賴關(guān)系，和系統(tǒng)層面的組織架構(gòu)。這一方法為理解生命系統(tǒng)的魯棒性提供了全新的視角，也有望揭示出具體生物系統(tǒng)衰老的根本原因。
楊一帆博士的現(xiàn)有工作表明，1）大腸桿菌和人類等生物體的衰老過(guò)程，與汽車，飛機(jī)等工程系統(tǒng)的衰老過(guò)程，分別可以用兩種不同的定量規(guī)律來(lái)描述，而生物體與工程系統(tǒng)之間有定性差異；2）從大腸桿菌到小鼠等多種模式生物的衰老過(guò)程，可以被一個(gè)普適的低維隨機(jī)微分方程所描述。
這一系列成果也就引出了一些更深層的問(wèn)題：為什么完全不同的生物體的衰老會(huì)有相同的動(dòng)力學(xué)過(guò)程？生命系統(tǒng)與工程系統(tǒng)在系統(tǒng)架構(gòu)上有什么本質(zhì)區(qū)別？本課題組將從第一性原理上解釋以上問(wèn)題。
（二）應(yīng)激反應(yīng)和細(xì)胞周期調(diào)控中的系統(tǒng)規(guī)律
以上系統(tǒng)學(xué)層面的理論研究，也需要在較為簡(jiǎn)單的生物體通過(guò)實(shí)證檢驗(yàn)。裂殖酵母和大腸桿菌等微生物系統(tǒng)，由于其較短的繁殖周期和快速的進(jìn)化能力，為實(shí)證檢驗(yàn)此類理論提供了實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。
裂殖酵母乃至一些細(xì)菌物種，在過(guò)去幾十年為理解衰老的細(xì)胞學(xué)原理做出了很多貢獻(xiàn)。楊一帆博士的工作，成功地顯示了許多哺乳動(dòng)物上發(fā)現(xiàn)的衰老動(dòng)力學(xué)過(guò)程，在大腸桿菌這樣的原核單細(xì)胞生物中也依舊適用。
如同哺乳動(dòng)物有多種組織，單細(xì)胞生物也有多個(gè)細(xì)胞器。不同細(xì)胞器由于功能活動(dòng)和結(jié)構(gòu)不同，在衰老過(guò)程中所積累的損傷也不一樣。但這些生物體雖然如此復(fù)雜，卻在整體呈現(xiàn)出較為簡(jiǎn)單的動(dòng)力學(xué)過(guò)程：大腸桿菌的損傷動(dòng)態(tài)可以由一個(gè)一維的隨機(jī)微分方程描述。這說(shuō)明不同損傷之間的相互作用導(dǎo)致其整體可以用一個(gè)整體變量來(lái)描述（平均場(chǎng)近似）。
本課題組將以裂殖酵母等微生物為模式體系，進(jìn)一步在活體中探索不同細(xì)胞器所受損傷的動(dòng)態(tài)學(xué)過(guò)程，以及其相互作用網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。此研究方向中我們會(huì)主要使用縮時(shí)顯微，移液機(jī)器人等自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，探索細(xì)胞損傷，應(yīng)激反應(yīng)和細(xì)胞周期調(diào)控中的定量規(guī)律。
（三）哺乳動(dòng)物衰老與組織穩(wěn)態(tài)
同時(shí)，課題組計(jì)劃利用已開(kāi)發(fā)的理論工具，用于開(kāi)發(fā)下一代的人類生理年齡的生物標(biāo)志物與時(shí)鐘。衰老生物學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)重要目標(biāo)是，開(kāi)發(fā)能衡量生理年齡而非絕對(duì)時(shí)間年齡的生物標(biāo)記物。這種生物標(biāo)記物可以有多種應(yīng)用，如用于抗衰老藥物的篩選，又比如用于個(gè)體化的精準(zhǔn)醫(yī)療和保健方案。
人們利用機(jī)器學(xué)習(xí)方法和多種組學(xué)如表冠基因組學(xué)數(shù)據(jù)，已經(jīng)開(kāi)發(fā)了多種衰老時(shí)鐘。其中用于標(biāo)定絕對(duì)時(shí)間年齡的時(shí)鐘可以成為年齡時(shí)鐘，而用于標(biāo)定生理?yè)p傷和生理年齡的可以稱為生理時(shí)鐘。組建這些時(shí)鐘的往往是數(shù)萬(wàn)個(gè)表冠遺傳學(xué)位點(diǎn)中，通過(guò)套索回歸等算法篩選出的數(shù)千個(gè)與年齡或生理狀態(tài)相關(guān)的位點(diǎn)。人們并不清楚這些位點(diǎn)所參與的生理過(guò)程，以及機(jī)理層面上與衰老過(guò)程的聯(lián)系。
楊一帆博士所參與發(fā)現(xiàn)的損傷動(dòng)力學(xué)模型，可以用于開(kāi)發(fā)下一代的生理時(shí)鐘，并建立時(shí)鐘與生理過(guò)程之間機(jī)理上的聯(lián)系。我們會(huì)開(kāi)發(fā)量身定做的機(jī)器學(xué)習(xí)方法，使用現(xiàn)有生物樣本庫(kù)和人類隊(duì)列研究的基因組學(xué)，來(lái)開(kāi)發(fā)能預(yù)測(cè)器官生理狀態(tài)和組織損傷的生理時(shí)鐘。我們希望此項(xiàng)研究能揭示人類和哺乳動(dòng)物組織衰老及組織穩(wěn)態(tài)的生物機(jī)理。
二、招聘崗位及條件
1.招聘崗位：
招聘崗位1：復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論方向博士后（1名）
招聘崗位2：微生物高通量實(shí)驗(yàn)與實(shí)驗(yàn)進(jìn)化方向博士后（1名）
招聘崗位3：計(jì)算功能基因組學(xué)與流行病學(xué)方向博士后（2名）
2.任職條件：
（1）（計(jì)算方向）擁有計(jì)算生物學(xué)，生物統(tǒng)計(jì)，統(tǒng)計(jì)物理，計(jì)算機(jī)科學(xué)，應(yīng)用數(shù)學(xué)等領(lǐng)域的博士學(xué)位，具有數(shù)學(xué)建模，統(tǒng)計(jì)建模，計(jì)算機(jī)編程和大數(shù)據(jù)整合能力；
（2）（實(shí)驗(yàn)方向）擁有生物學(xué)相關(guān)博士學(xué)位，具備分子、生化、細(xì)胞培養(yǎng)、基因組學(xué)等方面的實(shí)驗(yàn)背景；有酵母顯微解破，或定量建模，或高通量自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)方法經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先；
（3）（理論方向）擁有統(tǒng)計(jì)物理，計(jì)算機(jī)科學(xué)，應(yīng)用數(shù)學(xué)，人工智能等領(lǐng)域的博士學(xué)位，具有數(shù)學(xué)建模，計(jì)算機(jī)編程模擬，有滲流理論或隨機(jī)過(guò)程經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先；
（4）具有出色的溝通能力和合作精神，邏輯嚴(yán)謹(jǐn)，擅長(zhǎng)英文溝通與寫(xiě)作；
（5）已獲得或即將獲得博士學(xué)位，年齡不超過(guò)35周歲。
（6）年齡不超過(guò)35周歲；已取得或即將取得博士學(xué)位；
三、薪酬待遇
1.根據(jù)個(gè)人科研工作能力提供具有市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力的薪酬，具體面議。實(shí)驗(yàn)室將提供穩(wěn)定的工作環(huán)境與一流的研究平臺(tái)，協(xié)助申報(bào)博士后相關(guān)項(xiàng)目等。
2.學(xué)?？蓞f(xié)助辦理落戶、協(xié)助對(duì)接子女的入學(xué)入托服務(wù)工作。
3.學(xué)校提供全方位培養(yǎng)體系，設(shè)立“西湖大學(xué)優(yōu)秀博士后”“西湖優(yōu)秀女性博士后獎(jiǎng)”等項(xiàng)目。
四、資助政策
1.博士后可享受杭州市在站博士后資助政策。
2.對(duì)獲得中國(guó)博士后科學(xué)基金資助和浙江省博士后擇優(yōu)項(xiàng)目資助的，杭州市給予1:1配套資助。
3.對(duì)出站留杭（來(lái)杭）工作的博士后，杭州市給予每人40萬(wàn)元補(bǔ)助。
4.對(duì)來(lái)杭工作符合條件的全球本科及以上學(xué)歷應(yīng)屆畢業(yè)生（含畢業(yè)5年內(nèi)的回國(guó)留學(xué)人員、外國(guó)人才），杭州市發(fā)放生活補(bǔ)貼，其中博士10萬(wàn)元。
5.可申請(qǐng)認(rèn)定杭州市高層次人才，并享受相應(yīng)政策。
五、應(yīng)聘方式
請(qǐng)將以下材料以PDF形式發(fā)送至yangyifan@westlake.edu.cn，郵件標(biāo)題請(qǐng)注明：“應(yīng)聘（實(shí)驗(yàn)/計(jì)算）方向博士后+本人姓名+高校人才網(wǎng)”，對(duì)于符合要求并通過(guò)初審者，將會(huì)通知安排面試。招聘啟事在崗位招滿前有效。【快捷投遞：點(diǎn)擊下方“立即投遞/投遞簡(jiǎn)歷”，即刻進(jìn)行職位報(bào)名】
1.求職信（簡(jiǎn)要說(shuō)明您的研究經(jīng)歷以及您對(duì)我們實(shí)驗(yàn)室感興趣的原因）；
2.個(gè)人簡(jiǎn)歷?（包括詳細(xì)的學(xué)習(xí)工作經(jīng)歷、研究?jī)?nèi)容和完整的出版物清單）；
3.任何其他佐證您學(xué)術(shù)能力的文件；
4.面試結(jié)束后請(qǐng)?zhí)峁W(xué)歷學(xué)位證明材料,及相應(yīng)推薦人的聯(lián)系方式（2位，含博士導(dǎo)師）。
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