廣州醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院的前身為成立于2003年的藥學(xué)系，2012年5月，由原藥學(xué)系、化學(xué)教研室、藥理教研室、藥學(xué)實(shí)驗(yàn)中心、蛇毒研究所、藥物研究中心組建而成。2015年隨著學(xué)校進(jìn)入廣東省高水平大學(xué)建設(shè)行列，藥學(xué)院進(jìn)入快速發(fā)展期，2016年成為廣東省高等學(xué)校試點(diǎn)學(xué)院，2019年藥學(xué)專業(yè)通過(guò)國(guó)家教育部專業(yè)認(rèn)證，2020年藥學(xué)專業(yè)獲批國(guó)家一流本科專業(yè)，2021年臨床藥學(xué)專業(yè)再次獲批國(guó)家一流本科專業(yè)，是一個(gè)集教學(xué)、科研、轉(zhuǎn)化、創(chuàng)新于一體的二級(jí)學(xué)院。