浙江清華長三角研究院：是習(xí)近平同志在浙江工作期間親自謀劃、親自定名、親自部署、親自推動下，由浙江省人民政府和清華大學(xué)共建的新型創(chuàng)新載體，是浙江省實施「引進大院名校，共建創(chuàng)新載體」戰(zhàn)略的先行者、引領(lǐng)者。多年來，在省校大力支持下，研究院已逐步成長為清華大學(xué)重要的產(chǎn)學(xué)研試驗平臺和成果轉(zhuǎn)化基地，發(fā)展成績及省校合作成果獲得習(xí)近平總書記批示肯定。自 2003 年成立以來，研究院扎根嘉興、立足浙江、面向長三角，探索出了一條省校合作的發(fā)展新路。已獲批國家級科技企業(yè)孵化器、國家國際科技合作基地、國家海外人才離岸創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)基地、國家海智計劃工作基地等 4 個國家級創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)平臺，代表浙江省籌備組建長三角國家技術(shù)創(chuàng)新中心（浙江）?，F(xiàn)有全職員工 1050 人，其中全職院士 2 人（另有柔性 13 人）、全職（全時）國家級人才 14 人、清華師生及校友超 100 人。

生物技術(shù)與醫(yī)藥研究所：成立于 2006 年 1 月 12 日，是研究院建院之初建立的五所一中心之一。研究所擁有一個省級重點實驗室-全省多維組學(xué)與分子酶學(xué)重點實驗室，此外具有包括高等模式動物研究中心等多個中心。研究所立足于生物醫(yī)學(xué)發(fā)展前沿，以學(xué)科上有明顯的優(yōu)勢和特點著力打造四個生物醫(yī)藥孵化平臺: 細(xì)胞治療孵化平臺、體外診斷孵化平臺、新藥創(chuàng)制孵化平臺和海洋生物醫(yī)藥孵化平臺。擬通過孵化能力建設(shè)，在嘉興科技城孵化一批生物醫(yī)藥初創(chuàng)企業(yè)，進而帶動生物醫(yī)藥科創(chuàng)園的建設(shè)。生物所創(chuàng)辦的宗旨是打造國際一流的新型創(chuàng)新載體。生物技術(shù)與醫(yī)藥研究所的任務(wù)是整合清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、醫(yī)學(xué)院和藥學(xué)院基礎(chǔ)科研能力，在嘉興打造生物醫(yī)學(xué)科技成果轉(zhuǎn)化基地。

高等模式動物研究中心：是浙江清華長三角研究院發(fā)起成立，嘉興市人民政府、南湖區(qū)人民政府和浙江清華長三角研究院共同支持建設(shè)的新型創(chuàng)新高端科學(xué)研究和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化平臺。旨在以雪貂為主體，開展精準(zhǔn)基因修飾高等模式動物構(gòu)建及相關(guān)研究，系統(tǒng)創(chuàng)建雪貂模式動物資源庫，圍繞高等哺乳動物大腦發(fā)育與功能、神經(jīng)系統(tǒng)疾病和呼吸系統(tǒng)疾病等方向開展前沿重大生物醫(yī)學(xué)問題研究及顛覆性技術(shù)突破，以多學(xué)科交叉融合、基礎(chǔ)研究與應(yīng)用轉(zhuǎn)化并重為特色，助力新質(zhì)生產(chǎn)力發(fā)展，持續(xù)推進科研創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化，確立嘉興市在國際上以雪貂為主體的高等模式動物科研創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化的品牌與領(lǐng)先地位。自中心成立以來，成功獲批國家動物模型技術(shù)創(chuàng)新中心協(xié)作分中心，并定名為「國家動物模型技術(shù)創(chuàng)新中心浙江基因編輯特種動物模型分中心」。