上海海關(guān)學(xué)院是中華人民共和國海關(guān)總署直屬的唯一一所普通高等學(xué)校，為碩士學(xué)位授予單位。其前身為創(chuàng)建于1953年的上海海關(guān)學(xué)校，1980年5月升格為上海海關(guān)?？茖W(xué)校，1996年4月更名為上海海關(guān)高等專科學(xué)校，2007年3月經(jīng)教育部批準(zhǔn)設(shè)立上海海關(guān)學(xué)院，2018年4月，獲批碩士學(xué)位授予單位和公共管理碩士、稅務(wù)碩士2個專業(yè)學(xué)位點，2021年獲批國際商務(wù)、翻譯碩士2個專業(yè)學(xué)位授權(quán)點，并納入上海市博士授予單位培育建設(shè)名單以及上海市博士后流動站建設(shè)籌備單位名單。
學(xué)?，F(xiàn)設(shè)有海關(guān)與公共管理學(xué)院、海關(guān)與公共經(jīng)濟(jì)學(xué)院、工商管理與關(guān)務(wù)學(xué)院、海關(guān)法律系、海關(guān)外語系、公共教學(xué)部、馬克思主義學(xué)院和檢驗檢疫技術(shù)交流部等八個院系（部）；設(shè)置了海關(guān)管理、海關(guān)檢驗檢疫安全、行政管理、物流管理、審計學(xué)、國際商務(wù)、稅收學(xué)、經(jīng)濟(jì)統(tǒng)計學(xué)、法學(xué)、英語等10個本科專業(yè)和公共管理、稅務(wù)、國際商務(wù)和翻譯4個專業(yè)學(xué)位點。海關(guān)管理專業(yè)為國家級一流本科專業(yè)建設(shè)點、稅收學(xué)專業(yè)為省級一流本科專業(yè)建設(shè)點，同時，海關(guān)管理專業(yè)為世界海關(guān)組織PICARD標(biāo)準(zhǔn)認(rèn)證專業(yè)。

學(xué)校的主要任務(wù)是立足海關(guān)、面向社會，培養(yǎng)符合海關(guān)事業(yè)和經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展需要的應(yīng)用型、復(fù)合型、涉外型的高素質(zhì)海關(guān)管理專業(yè)人才以及服務(wù)口岸物流和國際商務(wù)的外經(jīng)貿(mào)專業(yè)人才，積極開展海關(guān)理論研究和國際交流。學(xué)校同時承擔(dān)海關(guān)系統(tǒng)中、高級干部繼續(xù)教育、知識更新和業(yè)務(wù)培訓(xùn)等任務(wù)，并根據(jù)世界海關(guān)組織（WCO）的分工和亞太區(qū)域國家和地區(qū)的要求，逐步承擔(dān)該區(qū)域海關(guān)人員培訓(xùn)任務(wù)，履行相應(yīng)的國際義務(wù)。

學(xué)校設(shè)有海關(guān)與國家安全、海關(guān)風(fēng)險管理、報關(guān)、海關(guān)稅收、海關(guān)法等研究中心，緊密結(jié)合海關(guān)改革發(fā)展和雙邊、多邊、區(qū)域海關(guān)國際合作中面臨的熱點、難點問題開展科學(xué)研究。2009年，學(xué)校獲準(zhǔn)設(shè)立上海市社會科學(xué)創(chuàng)新研究基地、上海發(fā)展戰(zhàn)略研究所工作室。公開出版學(xué)術(shù)期刊《海關(guān)與經(jīng)貿(mào)研究》。